En el 692, los Itzaes abandonaron Chichen Itzá y regresaron en el 987, según la leyenda, bajo la conducción del gran sacerdote de Tula, Quetzalcoatl, que los Toltecas habían expulsado. Quetzalcoatl fundó una nueva ciudad al norte de la precedente y le dio el poder a una dinastía Itza antes de regresar al México Central.

Los Itzaes reinaron en la ciudad durante dos siglos y construyeron la "Pirámide de Kukulcán" (traducción Maya de Quetzalcoatl) en honor a su fundador.
Los Itzaes se unieron a los Cocomes de Mayapán y a los Xiues de Uxmal en el seno de lo que se conoce como "la Liga de Mayapán". Pero esta alianza fue rota por los Cocomes en 1194 y los príncipes de Chichen Itzá fueron expulsados de su ciudad.

A partir de esta fecha la ciudad fue abandonada poco a poco, y fueron erigidas muy pocas estelas y monumentos nuevos.
En 1533 los españoles ocuparon un tiempo Chichen Itzá. El primer europeo que se interesó en el lugar fue el obispo Diego de Landa (1566). Pero no fue sino hasta en el siglo XIX que los arqueólogos la dieron a conocer al mundo.

Chichen Itzá es el sitio arqueológico mexicano más conocido. Lo debe a sus monumentos majestuosos y perfectamente restaurados. El Castillo (Pirámide de Kukulcán) domina el sitio. Pero otros edificios tienen mucha importancia también: El Juego de Pelota, uno de los más grandes del área meso-americana; El Templo de las mil columnas, custodiado por un Chac Mool impresionante.
Se puede visitar además los cenotes, esos pozos naturales que servían también para los rituales y los sacrificios, y sin los cuales la vida en Chichen Itzá no hubiese sido posible.